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要在虚拟主机上同时运行两个独立网站，首先需要确保虚拟主机支持多站点功能，这可以通过设置不同的域名别名（CNAME）或使用虚拟目录来实现，为每个网站分配一个单独的域名，并在主机配置文件中进行相应的指向设置，如Apache和Nginx的虚拟主机配置文件中添加相应的server block，还需要分别管理各自网站的内容、数据库连接等设置，以确保两个网站的独立性。.
